Browsing by Subject "genominen valinta"
Now showing items 1-3 of 3
-
(2020)Genomic selection was adopted by dairy cattle breeding industry approximately ten years ago. The aim of this study was to compare realized selection differentials and generation intervals of ayrshire and holstein cows in two selection paths, sires of cows and dams of cows in breeding programs that were based either on progeny testing or genomic selection. Progeny testing was characterized by cow calves that were born in 2008–2009 and genomic selection by calves that were born in 2015–2016. These age groups were split further into groups of first calving heifers that had calved during 2010–2011 or 2017–2018. Data for this study was received from Faba co-op and analysis of the data was performed with R-software. Selection differentials in the selection path of dams of cows increased by 1,55 NTM units in ayrshire and 1,69 NTM units in holstein breed between the age groups. Selection differentials of the dams of the first calving heifers were a bit higher than that of the dams of the cow calves. Selection differentials in the sires of cows path were 4,83 NTM units higher in ayrshire and 1,98 NTM units higher in holstein in the breeding program based on genomic selection than progeny testing. Generation interval reduced from 5,3 to 3,3 years in ayrshire and from 5,0 to 3,1 years in holstein breed. Biggest reduction in generation interval was observed in the selection path of sires of bulls, where the generation interval reduced 61 % in ayrshire and 65 % in holstein breed. Sires of cows path showed 31 % reduction in ayrshire and 32 % reduction in holstein and dams of bulls path 45 % reduction in ayrshire and 30 % reduction in holstein breed. Transfer from breeding program based on progeny testing to breeding program based on genomic selection had no influence on the generation interval of the dams of cows path. Selection differentials in the sires of cows path were higher in holstein than in ayrshire in both progeny testing and genomic selection schemes and they increased more in ayrshire breed. Selection differentials of the sires and dams of first calving heifers were a bit higher than of the dams and sires of all cow calves. As expected, genomic selection has reduced generation interval and the biggest change has occurred in sires of bulls path.
-
(2014)Uusilla jalostusmenetelmillä voidaan nopeuttaa karjan perinnöllistä edistymistä, mutta niiden käyttö myös lisää kustannuksia. Tässä tutkimuksessa selvitettiin genomisen valinnan ja sukupuolilajitellun siemenen käytön taloudellista kannattavuutta lypsykar-jatilalla. Tarkastelukulmana oli karjan sisäisen lehmävalinnan tehostaminen. Tutkimuksessa arvioitiin, saadaanko lisäpanostus jalostukseen nettotuottoina takaisin lyhyellä, viiden vuoden tarkasteluperiodilla. Tutkimus toteutettiin yhteistyössä Savonia ammattikorkeakoulun Maili-hankkeen kanssa ja tutkimuksessa oli mukana pohjoissa-volaisia maitotiloja C2-tukialueelta. Tiloja oli yhteensä 15 ja ne olivat noin 30-, 65- ja 130-lehmän karjoja. 30-lehmän karja edus-taa tämän hetken keskivertokokoa ja näillä tiloilla oli parsinavetta. Isommat karjat olivat automaattilypsyllä toimivia pihattoja. Läh-tötietoina käytettiin tilojen vuoden 2012 tuotosseurannan ja kirjanpidon tietoja. Tutkimustilojen keskituotos oli keskimäärin 9834 kg, jalostusarvojen ja odotusarvojen keskiarvo oli 4,2. Poistoprosentti oli tutkimustiloilla keskimäärin 29,8, vasikkakuolleisuus 7,5 prosenttia ja siemennyksiä yhtä poikimista varten tarvittiin keskimäärin 2,0. Tutkimusmenetelmänä käytettiin nettonykyarvolaskentaa, jossa nettokassavirrat diskontattiin nykyhetkeen, koska tulot ja menot kertyvät eri ajankohtina. Korkokantana käytettiin 5 prosenttia. Tarkastelussa käytettiin osittaisbudjetointia, jossa otetaan huomi-oon kassavirrat, joihin jalostusmenetelmät vaikuttavat. Lypsykarjalle genomisen valinnan käyttö aiheuttaa kustannuksia näyt-teidenoton ja -määritysten muodossa. Hyödyt puolestaan konkretisoituivat arvosteluvarmuuden paranemisena, joka vaikutti suo-raan perinnöllisen edistymisen suuruuteen. Tutkimuksessa käytettiin Illumina Bovine54K- ja Illumina Bovine3K-lastujen arvoste-luvarmuuksia, koska Illumina Bovine10K-lastun arvosteluvarmuus ei ollut tutkimushetkellä saatavilla. Hintoina on käytetty 54K- ja 10K-lastujen hintoja. 54K-lastua kutsutaan MD- eli medium density -lastuksi ja 10K- ja 3K-lastuja LD eli low density -lastuiksi. Sukupuolilajitellun siemenen käytöllä pystyttiin vaikuttamaan valinnan ankaruuteen. Tällöin tarvittiin pienempi määrä lehmiä ja hiehoja tuottamaan uudistukseen tarvittavat eläimet, koska lehmävasikoiden todennäköisyys nousi lajitellun siemenen ansiosta 49 prosentista 90 prosenttiin. Sukupuolilajiteltu siemen lisäsi kuitenkin kuluja, koska siemenannosten hinnat olivat lajittelematonta siemenannosta korkeampia. Kustannuksia lisäsi myös lajitellun siemenen heikompi tiineyttämiskyky perinteiseen verrattuna. X-lajitellun siemenen käyttö lisäsi lehmävasikoiden määrää, jolloin tilalta välitykseen menevien sonnivasikoiden määrä väheni. Laji-tellun siemenen käyttö mahdollisti liharotusiemennysten lisäämisen. Uusien jalostusmenetelmien vaikutusta tutkittiin arvioimalla niiden aikaansaamaa muutosta maitotuotokseen, hedelmällisyyteen, utareterveyteen ja kestävyyteen yhden valintakierroksen aikana. Kustannukset ja tuotot laskettiin valintavuoden lisäksi viidelle seuraavalle vuodelle, jolloin valinnasta syntyvien jälkeläisten oletettiin tuottavan karjassa kolme tuotosvuotta. Maitotuotoksen muutoksessa huomioitiin muuttuva rehuntarve ja työmäärä. Navetan täyttöasteen oletettiin lehmien osalta pysyvän vakiona. Tar-kasteluajanjakso valittiin seuraamaan nopeaa takaisinmaksua, eikä perinnöllisen muutoksen kumulatiivista vaikutusta huomioitu. Myös jalostuseläinkauppa on tästä tarkastelusta rajattu pois. Tämän tutkimuksen mukaan uudet jalostusmenetelmät eivät olleet kannattavia vuoden 2013 hintatason mukaan. Lajitellun sie-menen käyttö ei ollut kannattavaa, koska sitä käytettäessä sonnivasikoiden määrä väheni ja sitä kautta välitysvasikkatulot piene-nivät. Tilojen kannattaisi maksaa lajitellusta siemenannoksesta keskimäärin 5,50 euroa alhaisempaa hintaa kuin lajittelematto-masta siemenannoksesta. Lajiteltua siementä käytettäessä liharoturisteytyssiemennyksiä voitiin lisätä noin 8 prosenttiyksikköä. Ilman lihasonnien käytön lisäämistä lajitellun siemen käyttö oli enemmän kannattamatonta. MD-lastulla genomisen valinnan kannattava enimmäishinta oli 36–43 euroa riippuen siitä, tehtiinkö määritettävissä eläimissä esivalintaa. LD-lastulla vastaavat enimmäishinnat olivat 34–41 euroa. Lajitellun siemenen käyttö yhdessä genomisen valinnan kanssa ei muuttanut MD-lastun enimmäishintoja, mutta LD-lastun kanssa enimmäishinnat putosivat 30–36 euroon.
-
(2014)Tutkielman tavoitteena oli arvioida genomiarvostelujen toteutunutta luotettavuutta analysoimalla genomiarvostelujen ja jälkeläisarvostelujen välistä yhteyttä. Lisäksi tavoitteena oli selvittää, muuttuuko parhaiden sonnien keskinäinen paremmuusjärjestys arvostelujen välillä ja, miten suuri on genomiarvostelussa keinosiemennyssonnien odotettu ja toteutunut valintaero sekä perinnöllinen edistyminen jälkeläisarvosteluun verrattuna. Aineisto koostui vuonna 2008 syntyneistä Viking Genetics:n holstein-sonneista, joilla oli vuodelta 2012 genomiarvostelutulokset ja vuodelta 2014 jälkeläisarvostelutulokset. Tulosten mukaan genomiarvostelun luotettavuus tuotosindeksille oli 0,48 ja vastaavasti arvosteluvarmuus 0,69. Genomiarvostelujen ja jälkeläisarvostelujen väliset korrelaatiot vaihtelivat 0,52:n ja 0,73:n välillä indeksistä riippuen. Tulosten mukaan genomiarvostelun perusteella voidaan ennustaa jälkeläisarvostelutuloksia kohtalaisen luotettavasti, mutta yksittäisten sonnien tulokset ja sonnien keskinäiset järjestykset voivat vaihdella huomattavan paljon. Genomiarvostelussa arvostelujen luotettavuus ja valinnan tarkkuus ovat jonkin verran heikompia kuin jälkeläisarvostelussa. Kuitenkin genomiarvostelun lyhemmän sukupolvien välisen ajan takia perinnöllinen edistyminen on nopeampaa. Tulosten mukaan perinnöllinen edistyminen on suurempaa genomiarvostelussa jälkeläisarvosteluun verrattuna, kunhan genomiarvostelun sukupolvien välinen aika on vähemmän kuin 4,35 vuotta.
Now showing items 1-3 of 3